Amidase (AMD)
Ensím:Eru stórsameindalíffræðilegir hvatar, flest ensím eru prótein
Amidasi:Hvata vatnsrof ýmissa innrænna og erlendra alifatískra og arómatískra amíða með því að flytja asýlhóp yfir í vatn með framleiðslu á frjálsum sýrum og ammoníaki.Hýdroxamsýrur og aðrar lífrænar sýrur eru mikið notaðar sem lyf vegna þess að þær eru hluti af vaxtarþáttum, sýklalyfjum og æxlishemlum.Hægt er að skipta amídösunum í R tegund og S tegund acylasa í samræmi við stereóselectivity hvata.
Auk þess að hvata vatnsrof amíðs getur amidasi einnig hvatt asýlflutningshvörf í viðurvist samhvarfefna eins og hýdroxýlamíns.
Amidasa með mismunandi uppsprettur hefur mismunandi hvarfefnissérhæfni, sum þeirra geta aðeins vatnsrofið arómatísk amíð, sum þeirra geta aðeins vatnsrofið alífatísk amíð og önnur vatnsrofið α-eða ω-amínóamíð.Flest amínin hafa góða hvatavirkni aðeins fyrir ósýklísk eða einföld arómatísk amíð, en fyrir flókin arómatísk amíð eru heterósýklísk amíð, sérstaklega amíð með ortho tengihópa, almennt lítil í virkni (aðeins örfá ensím sýna betri hvataáhrif).
Hvatakerfi:
Ensím | Vörukóði | Vörukóði |
Ensímduft | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | sett af 19 amídösum, 50 mg hver 19 hlutir * 50mg / hlut, eða annað magn |
Skimunarsett (SynKit) | ES-AMD-1900 | sett af 19 amidasum, 1 mg hver 19 hlutir * 1mg / hlut |
★ Hár undirlagssérhæfni.
★ Sterk skurðaðgerð.
★ Mikil viðskipti skilvirkni.
★ Minni aukaafurðir.
★ Væg viðbragðsskilyrði.
★ Umhverfisvæn.
➢ Ensímskimun ætti að fara fram fyrir sérstök hvarfefni vegna sérhæfðar hvarfefnis og fá ensím sem hvatar markhvarfefnið með bestu hvataáhrifum.
➢ Aldrei snerta erfiðar aðstæður eins og: hátt hitastig, hátt/lágt pH og lífrænan leysi með háum styrk.
➢ Venjulega ætti hvarfkerfið að innihalda hvarfefni, stuðpúðalausn (ákjósanlegasta hvarf pH ensíms).Samhvarfefni eins og hýdroxýlamín ættu að vera til staðar í asýlflutnings hvarfkerfi.
➢ AMD ætti að bæta síðast í hvarfkerfi með besta pH og hitastigi hvarfsins.
➢ Allar tegundir af AMD hafa ýmis kjörviðbragðsskilyrði, svo hvert þeirra ætti að rannsaka frekar fyrir sig.
Dæmi 1(1):
Vatnsrofsvirkni í mismunandi amíð undirlag
Undirlag | Sérstök starfsemi μmól mín-1mg-1 | Undirlag | Sérstök starfsemi μmól mín-1mg-1 |
Asetamíð | 3.8 | ο-OH bensamíð | 1.4 |
Própíónamíð | 3.9 | p-OH bensamíð | 1.2 |
Laktamíð | 12.8 | ο-NH2bensamíð | 1.0 |
Bútýramíð | 11.9 | p-NH2bensamíð | 0,8 |
Ísóbútýramíð | 26.2 | ο-Tólúamíð | 0.3 |
Pentanamíð | 22.0 | p-Tólúamíð | 8.1 |
Hexanamíð | 6.4 | Nikótínamíð | 1.7 |
Sýklóhexanamíð | 19.5 | Ísónkótínamíð | 1.8 |
Akrýlamíð | 10.2 | Picolinamide | 2.1 |
Metakrýlamíð | 3.5 | 3-fenýlprópíónamíð | 7.6 |
Prólínamíð | 3.4 | Indól-3-asetamíð | 1.9 |
Bensamíð | 6.8 |
Hvarfið var framkvæmt í 50mM natríumfosfatjafnalausn, pH 7,5, við 70 ℃.
Amíð | Hýdroxýlamín | Hýdrasín |
Asetamíð | 8.4 | 1.4 |
Própíónamíð | 18.4 | 3.0 |
Ísóbútýramíð | 25.0 | 22.7 |
Bensamíð | 9.2 | 6.1 |
Hvarfið var framkvæmt í 50mM natríumfosfatjafnalausn, pH 7,5, við 70 ℃.
Tengdur styrkur hvarfefna: amíð, 100 mM (bensamíð, 10 mM);hýdroxýlamín og hýdrasín, 400 mM;ensím 0,9 μM.
Dæmi 2(2):
Dæmi 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., o.fl.Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, o.fl.Process Biochemistry, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, o.fl.Lífræn efnafræði, 2017, fáanlegt á netinu 7.